• Mesocena Ehrenberg, 1843 †
• Mesocena annulus Haeckel †
• Mesocena apiculata †
• Mesocena bioctonaria Ehrenberg †
• Mesocena bispicata P.F. Ciesielski in C.A. Shaw & P.F. Ciesielski, 1983 †
• Mesocena circulus (Ehrenberg, 1840) Ehrenberg, 1844 †
• Mesocena concava K. Perch-Nielsen, 1976 †
• Mesocena connudata D. Bukry, 1978 †
• Mesocena convexa T.V. Desikachary, P.M. Sreelatha & P. Prema, 1996 †
• Mesocena diodon †
• Mesocena dumitricae (K. Perch-Nielsen) D. Bukry †
• Mesocena elliptica (Ehrenberg, 1844) Ehrenberg, 1854 †
• Mesocena hexagona Haeckel, 1887 †
• Mesocena hexalitha D. Bukry, 1981 †
• Mesocena nodulifera †
• Mesocena oamaruensis Schulz, 1928 †
• Mesocena occidentalis G.D. Hanna ex D. Bukry †
• Mesocena occidentalis Hanna †
• Mesocena ovata D. Bukry, 1978 †
• Mesocena pappii A. Bachmann †
• Mesocena polyactis K. Tsumura †
• Mesocena polymorpha E. Lemmerman, 1901 †
• Mesocena quadrangula (P. Schulz) K. Tsumura †
• Mesocena quadrangula Ehrenberg †
• Mesocena quadrangula Ehrenberg ex Haeckel †
• Mesocena schulzii E. Martini & C. Müller, 1976 †
• Mesocena stellata Haeckel †
• Mesocena triodon Bukry, 1973 †
• Mesocena tsumurae D. Bukry †
• Mesocena tsumurai Bukry, 1977 † accepted as Mesocena schulzii E. Martini & C. Müller, 1976 †
• Mesocena venusta D. Bukry, 1977 †
• Mesocenaceae T.V. Desikachary & P. Prema, 1996 † accepted as Dictyochaceae Wallich, 1865