Achnanthes Bory de Saint-Vincent, 1822 (habitat flag source)
Achnanthidium Kützing, 1844 (habitat flag source)
Amphipleura Kützing, 1844 (habitat flag source)
Amphiprora Ehrenberg, 1843 (habitat flag source)
Amphora Ehrenberg ex Kützing, 1844 (habitat flag source)
Anabaena Bory de Saint-Vincent ex Bornet & Flahault, 1886 (habitat flag source)
Anabaenopsis V.V. Miller, 1923 (habitat flag source)
Aneumastus D.G. Mann & A.J. Stickle in F.E. Round, R.M. Crawford & D.G. Mann, 1990 (habitat flag source)
Ankistrodesmus Corda, 1838 (habitat flag source)
Aphanocapsa Nägeli, 1849 (habitat flag source)
Aphanochaete Braun, 1851 (habitat flag source)
Aphanothece Nägeli, 1849 (habitat flag source)
Arthrospira Sitzenberger ex Gomont, 1892 (habitat flag source)
Asterionella Hassall, 1850 (habitat flag source)
Audouinella Bory de Saint-Vincent, 1823 (habitat flag source)
Aulacoseira Thwaites, 1848 (habitat flag source)
Brachysira Kützing, 1836 (habitat flag source)
Caloneis P. Cleve, 1894 (habitat flag source)
Calothrix C.A. Agardh ex Bornet & Flahault, 1886 (habitat flag source)
Campylodiscus Ehrenberg ex Kützing, 1844 (habitat flag source)
Cavinula D.G. Mann & A.J. Stickle in F.E. Round, R.M. Crawford & D.G. Mann, 1990 (habitat flag source)
Centritractus E. Lemmermann, 1900 (habitat flag source)
Ceratium Schrank, 1793 (habitat flag source)
Chamaesiphon A. Braun in L. Rabenhorst, 1864 (habitat flag source)
Characium A. Braun in F.T. Kützing, 1849 (habitat flag source)
Chlamydocapsa Fott, 1972 (habitat flag source)
Chlamydomonas Ehrenberg, 1833 (habitat flag source)
Chlorochytrium Cohn, 1872 (habitat flag source)
Chlorogonium Ehrenberg, 1837 (habitat flag source)
Chroococcus Nägeli, 1849 (habitat flag source)
Chroomonas Hansgirg, 1885 (habitat flag source)
Chroothece A. Hansgirg in Wittrock & Nordstedt, 1884 (habitat flag source)
Chrysochromulina Lackey, 1939 (habitat flag source)
Chrysosphaerella Lauterborn, 1896 (habitat flag source)
Closterium Nitzsch ex Ralfs, 1848 (habitat flag source)
Cocconeis Ehrenberg, 1837 (habitat flag source)
Coelastrum Nägeli, 1849 (habitat flag source)
Coelosphaerium Nägeli, 1849 (habitat flag source)
Compsopogon Montagne in Durieu de Maisonneuve, 1846 (habitat flag source)
Cosmioneis D.G. Mann & A.J. Stickle in F.E. Round, R.M. Crawford & D.G. Mann, 1990 (habitat flag source)
Craticula Grunow, 1867 (habitat flag source)
Crucigenia Morren, 1830 (habitat flag source)
Crucigeniella Gaillon, 1833 accepted as Crucigenia Morren, 1830 (habitat flag source)
Cryptomonas Ehrenberg, 1831 (habitat flag source)
Cyclostephanos Round ex Theriot, Hakansson, Kociolek, Round & Stoermer, 1987 (habitat flag source)
Cyclotella (Kützing) Brébisson, 1838 (habitat flag source)
Cylindrotheca Rabenhorst, 1859 (habitat flag source)
Cymatopleura W. Smith, 1851 (habitat flag source)
Cymbella C.A. Agardh, 1830 (habitat flag source)
Denticula Kützing, 1844 (habitat flag source)
Dermocarpa P.L. Crouan & H.M. Crouan, 1858 (habitat flag source)
Diatoma Bory de Saint-Vincent, 1824 (habitat flag source)
Dictyosphaerium Nägeli, 1849 (habitat flag source)
Digereopsis accepted as Digeneopsis Simons, 1970 (habitat flag source)
Dinobryon Ehrenberg, 1834 (habitat flag source)
Diploneis Ehrenberg ex Cleve, 1894 (habitat flag source)
Encyonema Kützing, 1834 (habitat flag source)
Entocladia Reinke, 1879 (habitat flag source)
Epithemia Kützing, 1844 (habitat flag source)
Eunotia Ehrenberg, 1837 (habitat flag source)
Fallacia A.J. Stickle & D.G. Mann in Round, Crawford & Mann, 1990 (habitat flag source)
Fragilaria Lyngbye, 1819 (habitat flag source)
Fragilariforma D.M. Williams & F.E. Round, 1988 (habitat flag source)
Frustulia Rabenhorst, 1853 (habitat flag source)
Glenodinium Ehrenberg, 1836 (habitat flag source)
Gloeocapsa Kützing, 1843 (habitat flag source)
Gloeocystis Nägeli, 1849 (habitat flag source)
Gloeothece Nägeli, 1849 (habitat flag source)
Golenkinia Chodat, 1894 (habitat flag source)
Gomontia Bornet & Flahault, 1888 (habitat flag source)
Gomphonema Ehrenberg, 1832 (habitat flag source)
Gymnodinium Stein, 1878 (habitat flag source)
Gyrosigma Hassall, 1845 (habitat flag source)
Hantzschia Grunow, 1877 (habitat flag source)
Hyalodiscus Ehrenberg, 1845 (habitat flag source)
Hydrococcus Kützing, 1833 (habitat flag source)
Hydrocoleum Kützing ex Gomont, 1892 (habitat flag source)
Hydrurus C.A. Agardh, 1824 (habitat flag source)
Hyella Bornet & Flahault, 1888 (habitat flag source)
Hymenomonas Stein, 1878 (habitat flag source)
Karayevia F.E. Round & L. Bukhtiyarova ex F.E. Round, 1998 (habitat flag source)
Katodinium Fott, 1957 (habitat flag source)
Kirchneriella Schmidle, 1893 (habitat flag source)
Lagerheimia (G.B. De Toni, 1889) R. Chodat, 1895 (habitat flag source)
Luticola D.G. Mann in F.E. Round, R.M. Crawford & D.G. Mann, 1990 (habitat flag source)
Lyngbya C.A. Agardh ex Gomont, 1892 (habitat flag source)
Mastogloia Thwaites ex W. Smith, 1856 (habitat flag source)
Melosira C.A. Agardh, 1824 (habitat flag source)
Meridion C.A. Agardh, 1824 (habitat flag source)
Merismopedia Meyen, 1839 (habitat flag source)
Micractinium Fresenius, 1858 (habitat flag source)
Microchaete Thuret ex Bornet & Flahault, 1886 (habitat flag source)
Microcoleus Desmazières ex Gomont, 1892 (habitat flag source)
Microcrocis P. Richter in F. Hauck & P. Richter, 1892 (habitat flag source)
Microspora Thuret, 1850 (habitat flag source)
Monoraphidium Komárková-Legnerová in Fott, 1969 (habitat flag source)
Monostroma Thuret, 1854 (habitat flag source)
Nannochloris Naumann, 1921 (habitat flag source)
Navicula Bory de Saint-Vincent, 1822 (habitat flag source)
Neidium Pfitzer, 1871 (habitat flag source)